Santa Maria Reef ligt in het noordoosten van Comino, precies voor de Santa Maria Caves en met 22 meter diepte is het een duikstek geschikt voor duikers van alle niveaus. De boot ankert op een diepte van 10 meter. Alhoewel minder druk bezocht is dit een grote duikstek met twee algemene routes die men kan volgen. De routes worden vóór de duik gekozen aan de hand van de samenstelling van de duikgroep. Je vindt er verschillende tunneltjes en overstekken waar het wemelt van marien leven.